La société de conception de protéines basée sur l’IA, Profluent, a exploité l’intelligence artificielle pour concevoir un éditeur de gènes open source appelé OpenCRISPR-1, démontrant que la technologie peut être utilisée pour créer des molécules ayant le pouvoir de modifier l’ADN humain.
La technologie CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats), développée il y a plus de dix ans, permet aux scientifiques de modifier avec précision les séquences d’ADN au sein des organismes vivants.
Les applications potentielles vont du traitement des troubles génétiques à la recherche sur les mécanismes pathologiques.
Les molécules qu’elle conçoit sont entièrement synthétiques et n’existent pas dans la nature, contrairement aux technologies précédentes d’édition génétique, comme CRISPR-Cas9.
La société utilise OpenCRISPR-1 en open source pour une recherche éthique gratuite et une utilisation commerciale et publié la science derrière le développement de la protéine dans une publication pré-imprimée.
« Tenter de modifier l’ADN humain avec un système biologique conçu par l’IA était une réussite scientifique », a déclaré Ali Madani, cofondateur et PDG de Profluent, dans un communiqué. déclaration. « Notre succès laisse présager un avenir dans lequel l’IA conçoit avec précision ce qui est nécessaire pour créer une gamme de remèdes sur mesure contre les maladies. »
POURQUOI C’EST IMPORTANT
L’IA était au cœur de cette réussite, l’entreprise formant des modèles linguistiques à grande échelle (LLM) sur des séquences à grande échelle et sur un contexte biologique.
L’équipe Profluent a développé une base de données de 5,1 millions de protéines de type Cas9, et le modèle d’IA a été formé sur cette base de données pour créer des protéines potentielles pour une utilisation CRISPR.
Cela a permis au LLM de créer de nouveaux éditeurs de gènes à partir de zéro, en apprenant grâce à des exemples trouvés dans la nature.
Après avoir affiné les résultats, ils ont identifié OpenCRISPR-1, une protéine aux performances similaires à Cas9 mais avec beaucoup moins d’impact sur les sites non ciblés. Cela le rend plus précis et provoque des dommages minimes à l’ADN.
L’objectif de l’open source OpenCRISPR-1 est d’encourager l’utilisation de l’IA à des fins de recherche éthique et d’utilisation commerciale, en particulier dans le développement de médicaments tirant parti de CRISPR.
« Nous pensons qu’en agissant ainsi, nous pouvons contribuer à accélérer le rythme de la découverte et de l’innovation dans ce domaine », a déclaré Madani. « Notre vision est de faire en sorte que la biologie ne soit plus limitée par ce qui peut être réalisé dans la nature, mais qu’elle soit capable d’utiliser l’IA pour concevoir de nouveaux médicaments précisément en fonction de nos besoins. »
Il a ajouté que la société a l’intention de s’associer avec des instituts de recherche de pointe et des développeurs de médicaments travaillant tout au long du cycle de développement des médicaments pour permettre aux médicaments CRISPR d’être disponibles pour un plus grand nombre de patients et pour un plus grand nombre de troubles.
LA PLUS GRANDE TENDANCE
Les technologies d’édition génétique, notamment SHERLOCK et DETECTR, sont transformer le diagnostic numériquepermettant une détection rapide de maladies infectieuses telles que le COVID-19.
Des sociétés comme Atomwise, Deep Genomics et Valo intègrent l’édition génétique dans les processus de découverte de médicaments, révolutionnant ainsi le développement de traitements.
Au-delà de l’édition génétique, l’IA alimente tout, depuis logiciel d’analyse de la moelle osseuse à découverte de médicament et des plateformes pour aider associer les patients aux bons médicaments contre le cancer.
