Une approche informatique des données unificatrice pour la recherche multimodale

Une personne tapant sur un ordinateur portable, avec une superposition numérique montrant plusieurs fichiers rassemblés en un point central.

L’informatique des données dans la recherche sur les médicaments doit intégrer des données provenant d’une grande variété de sources et s’adapter aux chercheurs de plusieurs domaines.

Til terme produits biologiques fait référence à une classe de produits thérapeutiques produits à partir d’organismes vivants.¹ Bien que les produits biologiques soient utilisés en clinique depuis plus d’un siècle, leur importance a croissance exponentielle au cours des dernières décennies. Cette popularité a été alimentée par les progrès de la culture cellulaire, de l’édition génétique et de la technologie de recombinaison qui ont considérablement élargi la découverte de produits biologiques et les capacités de production de masse.²

Les avantages de la multimodalité

Les agents biologiques eux-mêmes sont également devenus plus complexeallant au-delà de la simple production de macromolécules naturelles pour les altérer ou les modifier pour une efficacité accrue ou un ciblage plus spécifique.³ Les produits biologiques d’aujourd’hui sont multimodaux : ils incorporent ou combinent plusieurs éléments distincts pour améliorer leur fonction. Par exemple, médicaments conjugués à des anticorps combiner le ciblage spécifique d’un anticorps avec la cytotoxicité d’un médicament à petites molécules, tout en peptides chimiquement modifiés posséder des fragments modifiés conçus pour modifier ou améliorer la fonctionnalité.^4,5 En effet, les composants biologiques peuvent couvrir toute la gamme des cellules aux protéines et aux acides nucléiques, et leur production et leur administration peuvent également impliquer des virus, des bactéries et des nanoparticules.

Les médicaments multimodaux peuvent offrir des avantages significatifs en termes de biodisponibilité, de durée d’activité, de spécificité de ciblage, d’efficacité et même d’efficience de production. Cependant, la production multimodale de médicaments nécessite une collaboration interdisciplinaire. La fabrication multimodale de médicaments peut nécessiter des experts en pharmacologie, biochimie, biologie cellulaire, chimie, biotechnologie et ingénierie des nanomatériaux, pour ne citer que quelques possibilités. Cependant, les scientifiques de différents domaines ont tendance à travailler indépendamment les uns des autres, chaque domaine développant ses propres procédures opérationnelles standard (SOP) spécifiques, non seulement en ce qui concerne les flux de travail, mais également en matière de prise de notes, de collecte et de gestion des données.

Solutions de données numériques

Bonne tenue de dossiers est essentiel pour maintenir la cohérence expérimentale et permettre une analyse précise des données,⁶ deux choses absolument vitales dans la recherche et la fabrication biopharmaceutiques. Numérisation permet une bonne tenue des dossiers, s’avérant vital pour agréger, rassembler et organiser des données provenant de différentes sources et stockées dans différents formats. Cela a à son tour stimulé la numérisation, en trouvant de la valeur dans la numérisation au-delà du simple changement du support de stockage des connaissances. De nombreux laboratoires maintenant, tourne-toi aux cahiers électroniques de laboratoire (ELN) et aux systèmes de gestion des informations de laboratoire (LIMS) pour rationaliser leurs opérations. Les ELN sont des systèmes conçus pour créer, stocker, récupérer et partager des enregistrements électroniques conformément aux besoins juridiques, réglementaires, techniques et scientifiques, tandis que les LIMS servent d’outils numériques pour la gestion des échantillons, de l’inventaire, du flux de travail, des SOP et des données.^6,7

La numérisation, bien qu’elle soit incontestablement utile à la rationalisation des flux de travail, de la recherche et de la fabrication, a également conduit au développement d’une multitude d’options ELN et LIMS nombreuses et variées. Sans une norme de référence bien définie, non seulement deux domaines pourraient différer lors du choix de leurs systèmes logiciels de gestion de données préférés, mais leurs systèmes pourraient également ne pas être compatibles, ce qui rendrait difficile le transfert de données de l’un à l’autre. En outre, les logiciels peuvent tout simplement ne pas être compatibles entre différents domaines : une suite conçue pour gérer les bases de données sur les petites molécules pourrait ne pas être capable de gérer les informations sur les peptides et les macromolécules. En conséquence, déplacer les données d’une partie d’un projet multimodal à une autre reste problématique.

Unifier l’informatique de laboratoire

Les scientifiques travaillent pour résoudre ces problèmes. Les nouvelles plates-formes informatiques de laboratoire peuvent gérer et suivre les entrées dans plusieurs domaines. Par exemple, les plateformes Sapio Sciences possèdent Enregistrement d’entité multimodale, un système unique capable de gérer les données sur les produits biologiques naturels et non naturels, y compris toutes les formes de conjugués, de peptides et de petites molécules. De plus, le système suit automatiquement la lignée des entités et des composants tout au long d’un flux de travail, échantillon par échantillon. En conséquence, la plateforme informatique de Sapio Sciences fonctionne à la fois comme un LIMS et un ELN, et les capacités d’enregistrement multimodal des entités signifient qu’une entité thérapeutique donnée peut être saisie dans la plateforme et visualisée par tout utilisateur du système de la manière la plus appropriée (par exemple , que ce soit en tant que molécule ou en utilisant un visualiseur HELM (Hierarchical Editing Language for Macromolecules)). La plateforme est également entièrement intégrée à l’existant de Sapio Sciences LIMS et Cahier de laboratoire électronique plates-formes. Il est également entièrement basé sur le cloud et ne nécessite rien de plus qu’un navigateur Web à jour.

Les suites logicielles informatiques de laboratoire modernes comme celles de Sapio Sciences, avec leurs capacités d’enregistrement d’entités multimodales, s’efforcent de lutter contre le cloisonnement, de permettre l’intégration et d’offrir une flexibilité dans la découverte, la recherche et le développement de médicaments, le tout afin que les scientifiques puissent suivre et accélérer le rythme rapide. paysage de recherche sur les maladies en évolution.