Sapient, une organisation de découverte de biomarqueurs fournissant des services sur mesure pour la génération et l’analyse de données multi-omiques, a annoncé le déploiement de ses services de découverte protéomique à haut débit, permettant de mesurer des milliers de protéines dans le sang et les tissus à travers diverses voies biologiques. Cette offre étend encore les capacités de Sapient en matière de découverte dynamique de biomarqueurs, en utilisant sa plateforme de pointe basée sur la spectrométrie de masse qui alimente également ses approches de découverte en métabolomique et en lipidomique.
« Nous sommes particulièrement ravis d’étendre les offres de Sapient pour inclure la protéomique de découverte », a déclaré Jeramie Watrous, PhD, co-fondateur et responsable de la R&D analytique chez Sapient. « La mesure du protéome, en particulier dans le sang, est un équilibre entre la profondeur et le débit des protéines. Il existe actuellement un certain nombre d’approches sur le marché pour la protéomique à grande échelle, et chacune d’elles a ses propres limites, que ce soit en termes de nombre de protéines analysées, de capture de protéoformes, de robustesse de l’annotation des protéines ou de extension à des espèces variées. Nous voulions nous assurer que notre offre de protéomique de découverte puisse répondre aux demandes variées de nos clients biopharmaceutiques et académiques et apporter une solution claire à chacun de ces défis critiques, en ligne avec la phase de développement ou les objectifs spécifiques de l’étude. Dans plusieurs matrices, y compris des échantillons précliniques et cliniques, nous pouvons générer des données sur des milliers de protéines à travers des milliers d’échantillons et intégrer ces données avec d’autres informations omiques pour amplifier le potentiel de découverte de biomarqueurs.
La spectrométrie de masse atteint une spécificité analytique élevée en mesurant directement les peptides pour annoter les protéines et les modifications post-traductionnelles (PTM). Les informations au niveau des peptides permettent une identification précise des protéines, et la capture des PTM permet une analyse plus approfondie de la fonction et de la régulation des protéines. La valeur de la méthode protéomique de découverte de Sapient réside également dans son évolutivité, car elle peut être optimisée pour la couverture protéique et le débit afin de répondre au mieux aux besoins bioanalytiques d’un client. Les options incluent :
- Sapient /HT/ Découverte : une approche efficace pour les études et les essais cliniques à grande échelle nécessitant d’analyser des milliers d’échantillons par semaine.
- Sapient /Core/Découverte : la méthode de base qui permet de mesurer >2 000 protéines par échantillon de plasma, avec un débit évolutif pour des dizaines, voire des milliers d’échantillons.
- Sapient/Profond/Découverte : pour les études recherchant la couverture protéomique la plus profonde, la méthode Sapient peut être optimisée pour maximiser la couverture protéique au sein d’un échantillon biologique donné.
Il est important de noter que les trois approches basées sur la spectrométrie de masse alimentent le pipeline bioinformatique de Sapient pour l’analyse statistique, y compris l’intégration de données multi-omiques avec des données génomiques, métabolomiques et lipidomiques ainsi que des mesures de résultats précliniques et cliniques.
« La protéomique de découverte est une extension naturelle de nos offres établies en métabolomique et en lipidomique, car les biomarqueurs protéiques, comme les métabolites et les lipides, sont des lectures dynamiques des changements biologiques entraînés par des facteurs génétiques et non génétiques », a déclaré Mo Jain, MD, PhD, Fondateur et PDG de Sapient. « Nous pensons que les prochaines perspectives permettant de faire progresser le développement de médicaments de précision se situent au-delà du génome, et collectivement, ces mesures basées sur les multi-omiques nous permettent d’interroger pleinement les biomarqueurs dynamiques de la santé humaine, des maladies et de la réponse aux médicaments pour nos clients.
« Je vois d’énormes avantages pour nos clients biopharmaceutiques qui cherchent à adopter des approches multi-omiques basées sur les données pour faire progresser leurs programmes de développement, de test et de déploiement de médicaments », a ajouté le Dr Jain.
