Des capes de polysaccharides appelées capsules ornent les bactéries pour les aider à échapper à la détection du système immunitaire et adapter à des environnements changeants.1 Des agents pathogènes comme Escherichia coli produisent des dizaines de types capsulaires, mais seuls quelques-uns sont associés à des maladies invasives. Dans un papier Publié dans Communications naturellesles chercheurs ont cartographié l’histoire génétique d’un virus particulièrement puissant E. coli cape – la capsule K1 – pour comprendre les secrets de son succès.2
Alex McCarthy, microbiologiste à l’Imperial College de Londres, et son équipe ont analysé les données mondiales de séquençage du génome entier provenant de plus de 5 000 échantillons cliniques d’infections sanguines, certaines antérieures à l’ère des antibiotiques. Ils ont reconstitué l’histoire évolutive du E. coli populations et cartographié l’émergence de gènes codant pour la capsule K1. Les résultats ont surpris l’équipe de McCarthy.
Environ 25 pour cent des bactéries échantillonnées codaient pour les gènes de la capsule K1, et le locus génétique de la capsule a émergé dans plusieurs lignées au cours des 500 dernières années. « C’était vraiment excitant et intéressant », a déclaré McCarthy. « Nous n’avions pas compris au préalable comment cette capsule a émergé indépendamment dans plusieurs clones différents de bactéries. »
« L’un des atouts qui leur a permis d’arriver à ce résultat est l’utilisation de bases de données impartiales », a déclaré Olaya Rendueles, microbiologiste à l’Institut Pasteur qui n’a pas participé à l’étude. L’équipe de McCarthy a utilisé un mélange d’ensembles de données, ce qui leur a permis de prendre un instantané de tous les pathogènes. E. coli.
L’équipe a également testé la survie de la capsule K1 dans le sérum humain in vitro. Quand ils ont ajouté un bactériophage enzyme à un mélange de sérum humain et E. coli, il a dépouillé la bactérie de son enveloppe protectrice, permettant au système immunitaire humain d’attaquer l’agent pathogène.
À l’avenir, McCarthy et son équipe espèrent comprendre comment la capsule K1 évolue pour éclairer de nouvelles mesures visant à contrôler et prévenir les infections.
Les références
- Nucci A, et coll. Nat Commun. 2022;13:4751.
- Arredondo-Alonso S, et al. Nat Commun. 2023;14:3294.
