Cette histoire est à l’origine est apparu dans Le Gardien et fait partie de la Bureau du climat collaboration.
Les canards et les corbeaux urbains peuvent nous offrir un lien avec la nature, mais les scientifiques ont découvert que les oiseaux sauvages qui vivent à proximité des humains sont plus susceptibles d’héberger des bactéries résistantes à des antibiotiques importants.
La résistance aux antimicrobiens (RAM) est en grande partie causée par la surutilisation de médicaments tels que les antibiotiques chez les humains et le bétail.
Le problème est très préoccupant : Selon les données de 2019environ 4,95 millions de décès dans le monde ont été associés à la résistance bactérienne aux antimicrobiens, dont 1,27 million directement causés par cette résistance.
Les chercheurs affirment que les espèces d’oiseaux sauvages qui ont tendance à apparaître dans les milieux urbains sont des réservoirs de bactéries présentant les caractéristiques d’une résistance à une multitude de médicaments.
« Fondamentalement, ce que nous voyons, ce sont des gènes qui confèrent une résistance aux antimicrobiens qui seraient utilisés pour traiter les infections humaines », a déclaré Samuel Sheppard, co-auteur de la recherche du Institut Ineos d’Oxford pour la recherche antimicrobienne.
L’équipe estime que leurs résultats sont importants car les oiseaux sauvages ont la capacité de se déplacer sur des distances considérables. Sheppard a déclaré que l’une des principales préoccupations était que ces oiseaux pourraient transmettre des bactéries résistantes aux antimicrobiens aux oiseaux captifs destinés à être mangés par les humains, comme ceux gardés dans les fermes avicoles.
Dans un article publié dans la revue Current Biology, Sheppard et ses collègues rapportent comment ils ont analysé les génomes de bactéries trouvées dans 700 échantillons d’excréments d’oiseaux provenant de 30 espèces d’oiseaux sauvages au Canada, en Finlande, en Italie, en Lituanie, au Japon, en Suède, au Royaume-Uni et aux États-Unis.
L’équipe a examiné spécifiquement la présence de différentes souches de Campylobacter jejuni—un type de bactérie omniprésente chez les oiseaux et qui fait naturellement partie de leur microbiome intestinal. Ces bactéries sont l’une des principales causes de gastroentérite humaine, bien que les antibiotiques ne soient généralement utilisés que dans les cas graves.
Sheppard a ajouté qu’en général, on s’attendrait à ce que chaque oiseau sauvage héberge une seule souche de C. jejunispécifique à cette espèce.
Cependant, l’équipe a découvert que les oiseaux sauvages qui se retrouvent dans les milieux urbains contiennent beaucoup plus de souches de C. jejuni que ceux qui vivent loin des humains.
De plus, les souches trouvées dans les espèces urbaines contenaient environ trois fois plus de gènes connus pour entraîner une résistance aux antimicrobiens, ces gènes étant également associés à une résistance à une gamme plus large d’antimicrobiens.
Les auteurs suggèrent que les oiseaux sauvages peuvent attraper des bactéries résistantes aux antimicrobiens de plusieurs façons : les mouettes et les corbeaux, par exemple, sont connus pour rôder dans les décharges, tandis que les canards et les oies peuvent les attraper dans les rivières et les lacs contaminés par les eaux usées humaines.
Thomas Van Boeckel, un expert en résistance aux antimicrobiens de l’ETH Zurich qui n’a pas participé aux travaux, a déclaré que la recherche était inhabituelle car elle se concentrait sur l’impact de l’utilisation d’antimicrobiens par les humains sur les animaux.
« Quelles sont les conséquences de ce phénomène sur les oiseaux ? Nous ne le savons pas vraiment, mais il semble que nous, les humains, soyons responsables de ce changement », a-t-il déclaré.
Danna Gifford, de l’Université de Manchester, a ajouté que ces résultats pourraient avoir des implications pour la santé humaine.
« Bien que le risque de transmission directe de la résistance des oiseaux urbains aux humains soit alarmant, il n’est pas clair. La transmission de la volaille à l’homme est en revanche bien documentée », a-t-elle déclaré. « Avec l’empiétement du développement urbain sur les terres agricoles, l’augmentation des contacts entre les oiseaux urbains et la volaille soulève de sérieuses inquiétudes quant à la transmission indirecte par la chaîne alimentaire. »
Andrew Singer, du Centre britannique d’écologie et d’hydrologie, a déclaré que davantage d’échantillons étaient nécessaires pour garantir la validité des résultats, mais que des précautions pouvaient être prises.
« La première étape consiste à s’assurer que les oiseaux ne se rassemblent pas dans nos décharges, nos usines de traitement des eaux usées et nos amas de déjections animales, où les agents pathogènes et la RAM sont abondants », a-t-il déclaré. « De plus, nous devons également éliminer le déversement d’eaux usées non traitées dans nos rivières, ce qui expose toute la faune qui fréquente les rivières – et les humains – aux agents pathogènes et à la RAM associés à l’homme. »
