Qu’y a-t-il dans le nom| Article
Il existe de nombreuses techniques permettant aux scientifiques de faire taire un gène, mais le caractère transitoire ou permanent de l’effet dépend du type d’approche.
Les chercheurs peuvent interroger expérimentalement la fonction d’un ou plusieurs gènes à l’aide d’outils de knock-out ou de knock-down. Bien que les deux approches interfèrent en fin de compte avec la fonction des gènes, les techniques de knock-out et de knock-down y parviennent grâce à des mécanismes distincts qui opèrent à des niveaux différents.
Inactivation génétique : une astuce à court terme
L’inactivation d’un gène réduit l’expression d’un gène au niveau de l’ARN. Les scientifiques utilisent souvent l’interférence ARN (ARNi) et les méthodes d’interférence par répétitions palindromiques courtes groupées et régulièrement espacées (CRISPRi) pour atteindre cet objectif. Alors que l’ARNi exploite l’interférence naturelle Voie de l’ARN interférent utilisé par les cellules pour identifier et cibler un ARN messager spécifique pour la dégradation, CRISPRi se lie à l’ADN et bloque soit l’initiation de la transcription, soit l’élongation selon la région à laquelle il se lie.1,2 Les deux techniques agissant au niveau de la transcription, il n’y a pas de changement dans la séquence d’ADN du gène, ce qui entraîne un effet phénotypique transitoire. Les chercheurs optent pour ce silençage génique temporaire lorsqu’ils étudient des gènes essentiels au développement d’un organisme et dont la suppression pourrait être mortelle.
Inactivation génétique : modification du schéma génétique
L’élimination complète des gènes est presque complète supprimer l’expression des gènes au niveau de l’ADN.3 Les chercheurs peuvent y parvenir en utilisant des outils d’édition du génome, tels que nucléases à doigt de zinc (ZFN), nucléases effectrices de type activateur de transcription (TALENS), et CRISPR et ses endonucléases associées.4-6 Ces outils produisent des cassures double brin sur des sites spécifiques de l’ADN, que la cellule tente de réparer à l’aide d’un mécanisme de réparation sujet à erreur qui peut modifier la séquence du gène cible. Comme les outils de knock-out entraînent un silençage génique durable, ils éliminent les effets de confusion qui pourraient subsister après l’inactivation du gène.